研究業績

論文

2025年

• "Crystal structure of glycoside hydrolase family 20 lacto-N-biosidase from soil bacterium Streptomyce sp. strain 142"
  Noriki Fujio, Shinya Fushinobu, Chihaya Yamada
  Journal of Applied Glycoscience (2025).

  • DOI: 10.5458/jag.7202101
• "Identification and structural characterization of a novel acetyl xylan esterase from Aspergillus oryzae"
  Chihaya Yamada, Tomoe Kato, Yoshihito Shiono, Takuya Koseki, Shinya Fushinobu
  FEBS J (2025).

2024年

• "Crystal structure of β‐d‐galactofuranosidase from Streptomyces sp. JHA19 in complex with an inhibitor provides insights into substrate specificity"
  Noriki Fujio, Chihaya Yamada, Toma Kashima, Emiko Matsunaga, Robert J. Nash, Kaoru Takegawa, Shinya Fushinobu
  FEBS Lett. 598, 23, 2866_2875 (2024).

2023年

• "A bacterial sulfoglycosidase highlights mucin O-glycan breakdown in the gut ecosystem"
  Toshihiko Katoh, Chihaya Yamada, Michael D Wallace, Ayako Yoshida, Aina Gotoh, Moe Arai, Takako Maeshibu, Toma Kashima, Arno Hagenbeek, Miriam N Ojima, Hiromi Takada, Mikiyasu Sakanaka, Hidenori Shimizu, Keita Nishiyama, Hisashi Ashida, Junko Hirose, Maria Suarez-Diez, Makoto Nishiyama, Ikuo Kimura, Keith A Stubbs, Shinya Fushinobu, Takane Katayama
  Nature Chemical Biology, 1-12 (2023).

2022年

• "Crystal structures of glycoside hydrolase family 136 lacto-N-biosidases from monkey gut- and human adult gut bacteria."
  Yamada C.*, Katayama T., and Fushinobu S.*
  Biosci. Biotechnol. Biochem. 32, 2, 171-180 (2022).
• "ヒト・動物の腸内に生息する嫌気性細菌の代謝機能～ビフィズス菌やメタン菌の代謝機能から応用研究への展開～"
  山田千早
  化学と生物 9月号 (2022).

2020年

• "Butyrate producing Clostridiales utilize distinct human milk oligosaccharides correlating to early colonization and prevalence in the human gut."
  Jakob Pichler M., Yamada C. (Co-first Author), et al.
  Nature communications 11, 3285 (2020).

2017年

• "Molecular insight into evolution of symbiosis between breast-fed infants and a member of the human gut microbiome Bifidobacterium longum."
  Yamada C. et al.
  Cell Chemical Biology 24, 515-524.e515 (2017).
• "Isolation and characterization of a thermostable lipase from Bacillus thermoamylovorans NB501."
  Yamada C. et al.
  J. Gen. Appl. Microbiol. 62, 313-319 (2017).
• "新規ファミリーに属するビフィズス菌由来ラクト-N-ビオシダーゼの立体構造"
  山田千早ら他
  応用糖質科学会誌 7, 2, 63-68 (2017).

2015年

• "Conductive iron oxides accelerate thermophilic methanogenesis from acetate and propionate."
  Yamada C. et al.
  J. Biosci. Bioeng. 119, 678-682 (2015).
• "利己的な腸内細菌バクテロイデスと利他的なビフィズス菌"
  山田千早
  日本生物工学会誌, 10, 627 (2015).

2014年

• "Reduction of Fe(III) oxides by phylogenetically and physiologically diverse thermophilic methanogens."
  Yamada C. et al.
  FEMS Microbiol. Ecol. 89, 637-645 (2014).
• "Inhibitory effects of ferrihydrite on a thermophilic methanogenic community."
  Yamada C. et al.
  Microbes Environ. 29, 27-230 (2014).

学会発表

2025年

• "ウサギやハチなど動物由来のビフィズス菌が持つヒトミルクオリゴ糖分解酵素の生物学的意義"
  石川遥菜, 野間愛叶, 熊谷優, 山口啓, 山田千早
  日本応用糖質科学会大会 (2025).
• "酪酸産生菌Roseburia inulinivorans由来のLewis a/b抗原特異的なGH136ファミリー糖質加水分解酵素のX線結晶構造解析"
  熊谷優, 鹿島騰真, 伏信進矢, ABOU HACHEM Maher, 山田千早
  日本応用糖質科学会大会 (2025).
• "伝統的壺造り純米黒酢醸造において酢酸発酵を支える乳酸菌Lactobacillus acetotolerans黒酢株の単離とゲノム解析"
  高村和花, 松谷峰之介, 川崎信治, 藤井暁, 新井博之, 山田千早
  日本乳酸菌学会 (2025).
• "壺造り純米黒酢醸造に関与する酢酸菌 Acetobacter pasteurianus の特性と乳酸菌との相互関係"
  横井信保、藤井暁、濱田健作、藤元勇樹、新井博之、山田千早
  酢酸菌研究会 (2025).
• "麹菌Aspergillus oryzae由来糖質加水分解酵素136ファミリーの機能解析"
  山口 啓、鹿島 騰真、中島 春紫、山田 千早
  日本農芸化学会関東支部大会 (2025).
• "伝統的壺造り純米黒酢醸造の発酵中期における乳酸菌の役割解明に向けて"
  磯西 琴羽、松谷 峰之介、川﨑 信治、藤井 暁、濱田 健作、藤元 勇樹、新井 博之、山田 千早
  日本農芸化学会関東支部大会 (2025).
• "壺造り黒酢の醸造過程における乳酸菌の D-アミノ酸生成に関与するラセマーゼの特性解析"
  佐々木舞、高村和花、松谷峰之介、藤井暁、濱田健作、藤元勇樹、新井博之、山田千早
  日本農芸化学会関東支部大会 (2025).

2024年

• "日本人に特徴的な還元的酢酸生成菌の多様性解析と共培養実験による酢酸生成への寄与"
  山口啓, 山田千早, 加藤創一郎
  日本農芸化学会大会 (2024).
• "伝統的壺造り純米黒酢醸造において酢酸発酵を支える乳酸菌Lactobacillus acetotolerans黒酢株の単離とゲノム解析 "
  高村和花, 松谷峰之介, 川崎信治, 藤井暁, 新井博之, 山田千早
  日本農芸化学会関東支部 (2024).